阳极保护系统在正常运行过程中，一般不需要操作人员过多管理。但这是一个电力运行的电化学保护系统，专业性、技术性很强，仍需要对其运行管理给于足够重视。应该由工艺操作岗位的工人对其进行日常操纵，监测电位、电流和实施维护。而专业性和技术性很强的特殊决策性工作则应该由有经验的防腐蚀工程师执行或在他们指导下完成。阳极保护电气系统应有专人负责。

在运行管理中，应将阳极保护系统的需用电流和操作条件按时间记录在报表上，储存在微机内。即使采用自动控制的维钝系统，操作人员除了注意控制参比电极所在部位的维钝状况外，还应关注其他参比电极所在部位的电位状况。

阳极保护系统的控制装置应该安装报警系统，当电位达到某个容许极限时就发出报警信号，并使该控制装置停止工作，由操作人员迅速处理有关故障。

为了检测保护系统在控制腐蚀方面的有效性，可以同时采用一些技术措施。因为所生产的产品纯度在许多工业设备中是阳极保护成功与否的重要判据，所以现场监测工艺溶液中的金属含量就成为评价保护成功的常用有效方法。采取溶液样品的操作和分析方法必须遵循有关标准和操作规范。为进行分析而采用的溶液样品，必须保证它们能真实代表所运行的工艺溶液。采取溶液样品时应十分小心。

此外，也可以安装电阻探针等，通过测量腐蚀速率的方法来监视被保护设备的腐蚀状况。