在强制电流阴极保护系统安装完毕后，下水前要检查每支阳极及参比电极的绝缘水密封情况，核对所有接线是否正确。下水时应及时进行调试。

在接通电源以前，将所有开关均放在关断状态，电位器调至 小，然后接通电源，调节阳极输出电流的大小，将给定电位调至保护电位上，然后测定全船壳的保护电位。当船艏和船艉的电位差50mV时，表明电位分布均匀，处于保护范围内，也说明系统中的阳极和参比电极布置是适当的。

当船舶在航行时，可将测量的转换开关旋至相应位置，利用附近的参比电极测量船壳的保护电位。

如果采用了铅银合金阳极，那么通电应在海水中进行，并应手控每支阳极的输出电流，处在 工作范围内，以便阳极表面形成牢固的二氧化铅导电膜，延长使用寿命。如果船体所需保护电流较低，平均每支阳极输出电流过小，达不到 排流量时，几支阳极可以分几组分别几次通电，待阳极表面形成较好的导电膜后，再全部接通阳极并采用自动控制。

航行中，若海区、航速等发生变化时，应观察自控装置运行情况，记录电流和电压的变化数据。必要时，重新调整给定电位值，以使全船各部位都处于保护状态。