水下构筑物保护系统有两种，一是水下牺牲阳极系统，二是强制电流阴极保护系统。
首先是水下牺牲阳极系统。采用牺牲阳极保护的 水下金属构筑物，通常3个月进行一次测量，测量项目为各代表性点上的保护电位和阳极输出电流。对于采用电缆与水下构筑物相连接的阳极，应该定期检查电缆因波浪、小船系泊所遭受到的破坏。当构筑物对水的保护电位不够负时，应该考虑更换阳极，必要时可以从水中提出若干有代表性的阳极进行检查。对于直接固定在水下构筑物的牺牲阳极，电流输出已测不出来，只能根据保护电位的测量，辅助之以阳极消耗方面的资料来确定。牺牲阳极管理维护中应该注意海水的污染程度，有时海水污染会严重影响到阳极的工作性能。
再就是强制电流阴极保护系统。水下金属构筑物的强制电流系统，主要是由调节输出电流来维持正常的保护。一般在运行的前几个月，由于极化需要较大的电流，如果设备不是自动控制的，便会造成过保护，引起覆盖层的破坏。管理中应该根据保护电位情况，及时调节电流。水的电阻率发生变化时，强制电流装置应该及时调整，不应该造成在电阻率变低时过保护的危险。
强制电流的输出电压、电流，应该每个月调节一次，并且研究潮汐变化的影响。在运行的第一年应该每月测量一次构筑物的保护电位。如果电位稳定了，可以每2-3个月测量一次。
